Repository of Research and Investigative Information

Repository of Research and Investigative Information

دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی زنجان

Thesis #7095

[error in script] (1390) شناسايي DNA و داروهاي ضد سرطان بر پايه روش رنگ سنجي با استفاده از نانوذرات طلا. پایان نامه مقطع Doctoral.

[img] Text
فاطمه فکرمندی فایل کامل.pdf - Published Version
Restricted to Repository staff only

Download (6MB)

Persian Abstract

تلومر و نواحي DNA به عنوان ساختار تنظيمي در ،(G-quadruplex) چهار رشته اي DNA تشكيل و استحكام بخشي روش نويني در درمان ضد سرطان محسوب مي شود. در (intercalator) پيشبرنده ژن ها، توسط ليگاندهاي بين رشته اي با انواع و ساختارهاي مختلف مورد بررسي قرار مي گيرد. اين DNA اين مطالعه ايده طراحي آرايه اي از نانوذرات طلا و آرايه با هدف به دست آوردن اطلاعات كيفي و كمي در مورد ليگاندهاي بين رشته اي ضد سرطان طراحي مي شود. توالي مكمل ،(G-DNA ) سه توالي 22 نوكلئوتيدي تك رشته اي شامل قطعه اي از توالي تلومر انساني غني از باز گوانين ژنومي DNA . شركت تكاپوزيست) سنتز شدند ) Bioneer توسط (R-DNA ) و يك توالي تصادفي (C-DNA) آن از شركت Actinomycin D و Ethidium Bromide ،Neutral Red ليگاندهاي ،(P-DNA ) تيموس گوساله با HAuCl 13 و 20 نانومتر) با روش احياي 4 ،10 ، خريداري شدند. سنتز نانوذرات طلا با سايزهاي مختلف ( 8 Sigma Circular از طريق تكنيك (G-DNA ) چهار رشته اي DNA تري سيترات سديم انجام گرفت. تعيين ساختاري انجام شد. در بررسي هاي رنگ سنجي، تصاوير ديجيتال نمونه ها ثبت و به طور چشمي و عددي (CD) Dichroism و ترسيم نمودارهاي دوبعدي و سه بعدي) تحليل شد. MATLAB تصاوير از طريق نرم افزار RGB (استخراج مقادير به عنوان تكنيك هاي كمكي مورد استفاده قرار گرفتند. UV فلوروسانس و جذب سنجي طيف در قدرت هاي يوني مختلف و غلظت هاي متفاوت ليگاند طراحي و بهينه DNA ، سيستم آرايه اي مطلوب با نانوذرات طلا تك رشته اي به سطح نانوذرات طلا باعث افزايش مقاومت آنها به افزايش نمك مي شود. در DNA سازي شد. جذب از سطح نانوذرات طلا جدا شده و تغيير رنگ قرمز به آبي اتفاق مي افتد. با اين G-DNA ، حضور ليگاند بين رشته اي DNA ) DNA و ليگاندهاي مختلف، اطلاعات كيفي و كمي در مورد حضور DNA تغيير ساده چشمي و مقايسه بين به DNA و تمايل ليگاند به (Ligand Detection and Quantification ) حضور و مقدار ليگاند ،(Detection دست آمد. در نتيجه يك سيستم آرايه اي بر پايه نانوذرات طلا براي اولين بار طراحي و ساخته شد؛ كه ساده، سريع و بدون نياز به ابزارهاي پيچيده، اطلاعات كيفي و كمي ارزشمندي درباره داروهاي ضدسرطان ارائه مي دهد. پيشنهاد مي شود ليگاندهاي هاي متنوع بيشتري با اين آرايه بررسي شوند و اين روش به ديگر مولكولهاي كوچك، پروتئين ها و DNA ضدسرطان و يون ها تعميم يلبد.

Title

Colorimetric Detection of DNA and Small Anticancer Drug Molecules using Unmodified Gold Nanoparticles

Abstract

Stabilizing G-quadruplexes as regulatory structures in telomere DNA and promoter regions by intercalator ligands provide a new route to anticancer therapies. The purpose of this study was to test the hypothesis that an array of unmodified gold nanoparticles and various DNA types and conformations could provide qualitative and quantitative information about intercalator anticancer ligands. Three single-stranded DNA (ss-DNA) sequences were synthesized: A 22-mer G-rich DNA (G-DNA) which carries a piece of the human telomeric sequence, its complementary sequence (C-DNA) and a random ss-DNA (R-DNA). Calf-Thymus (genomic) DNA was purchased from Sigma. The conformation of the G-DNA was characterized by Circular Dichroism (CD) spectroscopy. Gold nanoparticle (AuNP) synthesis was done by citrate reduction of HAuCl4. Neutral Red, Ethidium Bromide and Actinomycin D were purchased from Sigma. For colorimetric analysis, digital photographs of the arrays were taken and analyzed by MATLAB software for further quantification using Red-Green-Blue (RGB) values. Fluorescence and UV-Visible Spectroscopy were used as extra informative tools. The array system was designed and optimized with unmodified gold nanoparticles and DNA in different salt (ionic strength) and ligand concentrations. Electrostatic absorption of ss-DNA on Au-NP surface delays salt-induced Au-NP aggregation. The desorption of ss-DNA by ligand intercalation occurs and a red to blue color change is seen. The results were compared with C-DNA, R-DNA, GC-DNA (22bp, ds-DNA) and Calf-Thymus (genomic ds-) DNA. By this simple gradual color change, ligands could be detected (Ligand Detection) and quantified (Ligand Quantification) and their affinity to intercalate in G-DNA determined in a range of ionic strengths. An array system has been designed based on unmodified gold nanoparticles for the first time; which is simple, rapid, requiring no complicated apparatus and providing qualitative and useful quantitative information about small anti-cancer drug molecules. This array system not only could be extended to other anticancer drugs, but also to other molecules, protein and ions.

Item Type: Thesis (Doctoral)
Keywords: array system, G-quadruplex DNA, small anticancer drug molecules detection, ligand quantification, unmodified gold nanoparticles
Subjects: QZ Pathology > QZ 200-380 Neoplasms
Divisions: Education Vice-Chancellor Department > Faculty of Medicine > Departments of Clinical Sciences > Department of Pathology
Number of Pages: 73
Depositing User: خانم گیتی شاه محمدی
URI: http://repository.zums.ac.ir/id/eprint/7095

Actions (login required)

View Item View Item